新冠病毒蛋白與候選化合物作用數(shù)據(jù)公布
創(chuàng)新連線·日本
日本理化學(xué)研究所的研究小組利用“碎片分子軌道法(FMO法)”計算了新型冠狀病毒蛋白與治療藥候選化合物的分子間相互作用,并于近日在 “蛋白質(zhì)量子化學(xué)計算值數(shù)據(jù)庫(FMODB)”(https://drugdesign.riken.jp/FMODB/)中公開了數(shù)據(jù)。全球的藥物研發(fā)人員均可自由利用。
FMO法是通過量子化學(xué)計算(第一原理)描述分子間相互作用的方法。此次研究團(tuán)隊對錄入的131個立體結(jié)構(gòu)中的65個進(jìn)行了FMO計算,解析了病毒與治療藥候選化合物之間的相互作用(分子之間的引力和斥力等)。這些數(shù)據(jù)已在FMODB中公開,用戶可以參考這些數(shù)據(jù),精確評價治療藥候選化合物以何種機(jī)制與靶蛋白結(jié)合,從而設(shè)計出能與靶蛋白更緊密結(jié)合的有效治療藥物。
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