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首個對葉榕完整基因組發(fā)布 為榕屬植物性別演化提供重要資源

發(fā)布時間:2024-04-10 10:25:00來源: 光明網(wǎng)-《光明日報》

  【科技前沿】

  光明日報北京4月9日電(記者楊舒)對葉榕是一種廣泛分布于我國南方的植物。近日,中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所農(nóng)業(yè)基因組學(xué)技術(shù)研發(fā)與應(yīng)用創(chuàng)新團隊發(fā)布首個對葉榕的完整基因組,修正了此前學(xué)界對其基因組測序繪制中存在的大量間隙和組裝錯誤,大幅提升了對葉榕基因組的連續(xù)性、完整性和準確性,為榕屬植物性別演化提供了重要資源。

  據(jù)介紹,榕樹是??崎艑?00多種植物的統(tǒng)稱,廣泛分布于熱帶和亞熱帶地區(qū)。榕屬植物包含6個亞屬,一半雌雄同株(單棵榕樹上包含正常的雌花和雄花),一半功能性雌雄異株(雌榕樹僅含有雌花,雄榕樹包含雄花和短花柱雌花)。其中,對葉榕是聚果榕亞屬比較古老的雌雄異株植物,具有明顯的性別分化。從生物學(xué)角度看,解析對葉榕的基因組對研究榕屬植物性別分化及相關(guān)生物學(xué)性狀和基因功能至關(guān)重要,然而,此前對葉榕基因組存在大量的信息缺失和組裝錯誤,阻礙了進一步的研究。

  在國家自然科學(xué)基金等項目的支持下,科研團隊綜合利用多種測序技術(shù),在原有基因組基礎(chǔ)上重新組裝、完善,發(fā)布了首個對葉榕所有染色體端粒到端粒完整無間隙的基因組。該基因組大小371.8兆,所有序列均掛載到14條染色體上,成功注釋了26642個編碼蛋白基因,經(jīng)評估,基因組的完整度、連續(xù)性和準確性均得到了大幅提升。

  另據(jù)了解,科研團隊還進一步組裝榕屬植物首個完整的性別決定區(qū)域,鑒定榕樹的性別決定基因,并構(gòu)建對葉榕雄性和雌性花不同發(fā)育時期的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò),從而發(fā)現(xiàn)雄花發(fā)育的關(guān)鍵基因。

  《光明日報》(2024年04月10日 08版)

(責(zé)編:李雨潼)

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