體型小而表型性狀多 新研究揭示暹羅斗魚馴化史
暹羅斗魚是風(fēng)靡全球的一種小型觀賞魚,最早在1000年前左右被人類馴化。長(zhǎng)期以來,暹羅斗魚都因其多種多樣的體色、體型而備受人們的關(guān)注。
南昌大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院洪一江教授團(tuán)隊(duì)主要圍繞暹羅斗魚展開研究,開展群體遺傳學(xué)與全基因組關(guān)聯(lián)分析,很大程度上闡明了暹羅斗魚復(fù)雜的馴化歷史和表型多樣性的遺傳基礎(chǔ)。
近日,相關(guān)研究論文發(fā)表在刊物《科學(xué)進(jìn)展》上。
構(gòu)建高質(zhì)量染色體水平基因組
作為一種小型觀賞魚,暹羅斗魚擁有眾多的表型性狀。何種類型的分子突變,作用在哪些基因上從而導(dǎo)致暹羅斗魚形成這些表型性狀?這一過程的分子調(diào)控機(jī)制是什么?
要研究決定暹羅斗魚表型的基因,首先必須要有高質(zhì)量的參考基因組。研究團(tuán)隊(duì)是如何對(duì)斗魚的基因進(jìn)行測(cè)序的?
據(jù)悉,洪一江及其團(tuán)隊(duì)采用了多種測(cè)序策略與輔助組裝工作,構(gòu)建了暹羅斗魚高質(zhì)量染色體水平基因組,最終組裝的基因組大小達(dá)451.29Mb。
在獲得暹羅斗魚高質(zhì)量的參考基因組之后,團(tuán)隊(duì)青年教師張萬昌與泰國(guó)研究人員合作,收集了700多條代表不同表型的個(gè)體,提取了每一條魚的DNA,并利用Illumina平臺(tái)開展重測(cè)序工作,獲得了每個(gè)個(gè)體的大量測(cè)序結(jié)果。
這些測(cè)序結(jié)果都被定位到了暹羅斗魚的參考基因組上,通過對(duì)700多個(gè)個(gè)體的測(cè)算,獲得了總共約2000萬個(gè)變異位點(diǎn)。
為篩選相關(guān)靶點(diǎn)藥物提供良好研究模型
“我們對(duì)暹羅斗魚的研究為進(jìn)一步挖掘相關(guān)功能基因提供了天然的研究模型,在遺傳學(xué)、基因組學(xué)、發(fā)育生物學(xué)和神經(jīng)生物學(xué)等學(xué)科領(lǐng)域均具有一定的價(jià)值。”洪一江表示,“暹羅斗魚經(jīng)過歷史上多年以來的馴化和選育,已經(jīng)形成了諸多種類的表型變異?!卞吡_斗魚豐富而多樣的品種,為研究脊椎動(dòng)物形態(tài)學(xué)發(fā)生提供了天然的研究材料。
暹羅斗魚基因組大小在各種常見物種中較小,約為斑馬魚的1/4、小鼠的1/7。暹羅斗魚較小的基因組,使得暹羅斗魚成為了一種較為理想的研究物種。相對(duì)于其他研究物種,其遺傳學(xué)研究和分子克隆的相關(guān)成本都比較低。
此外,暹羅斗魚最顯著的特征就是善于進(jìn)行打斗。暹羅斗魚的打斗通常包含了前期恐嚇、相互接近、奮力搏斗和落敗一方逃離等具體過程。由于打斗的復(fù)雜性,對(duì)打斗這一行為的研究涉及遺傳學(xué)、神經(jīng)生物學(xué)、內(nèi)分泌學(xué)、組織生理學(xué)等多學(xué)科的許多復(fù)雜性狀。
“從我們的初步研究結(jié)果來看,在專門用于打斗的搏擊斗魚中,某些涉及神經(jīng)系統(tǒng)調(diào)控的基因受到了強(qiáng)烈的選擇?!焙橐唤硎荆拔覀冞€發(fā)現(xiàn),部分受選擇的基因在小鼠和人類研究中和精神疾病如精神分裂癥、雙向性格障礙、易怒等疾病密切相關(guān)。這為將來研究這些疾病,并進(jìn)一步篩選相關(guān)靶點(diǎn)藥物提供了很好的研究模型?!保ㄎ阂莱浚?/p>
版權(quán)聲明:凡注明“來源:中國(guó)西藏網(wǎng)”或“中國(guó)西藏網(wǎng)文”的所有作品,版權(quán)歸高原(北京)文化傳播有限公司。任何媒體轉(zhuǎn)載、摘編、引用,須注明來源中國(guó)西藏網(wǎng)和署著作者名,否則將追究相關(guān)法律責(zé)任。
- 我國(guó)制備出納米尺度上可滑動(dòng)機(jī)電諧振器
- 非凡十年看武漢 | 衛(wèi)星視角看“百鳥樂園”綠色答卷
- “夢(mèng)天”升空,中國(guó)空間站打響收官戰(zhàn)
- 三季度中國(guó)經(jīng)濟(jì)恢復(fù)向好(銳財(cái)經(jīng))
- 千年青瓷如何“活”起來?數(shù)字技術(shù)賦能青瓷藝術(shù)
- 適應(yīng)新規(guī)則 打出好成績(jī)(展望奧運(yùn)新周期)
- 萬里之遙何以運(yùn)籌帷幄
- “首店經(jīng)濟(jì)”又升級(jí)了
- 昆曲舞蹈跨界融合,“紅樓”再添別樣魅力
- 聽,跨境電商的“生意經(jīng)”